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自定义数据读取

自定义数据读取

基本要求:

我们将支持文件格式的任务分成两部分:

  • 文件格式: 我们使用 Reader Op来从文件中读取一个 record (可以使任意字符串)。
  • 记录格式: 我们使用解码器或者解析运算将一个字符串记录转换为TensorFlow可以使用的张量。

例如, 读取一个 CSV 文件,我们使用 一个文本读写器, 然后是从一行文本中解析CSV数据的运算

主要内容

自定义数据读取

编写一个文件格式读写器

Reader 是专门用来读取文件中的记录的。TensorFlow中内建了一些读写器Op的实例:

你可以看到这些读写器的界面是一样的,唯一的差异是在它们的构造函数中。最重要的方法是 Read。 它需要一个行列参数,通过这个行列参数,可以在需要的时候随时读取文件名 (例如: 当 Read Op首次运行,或者前一个 Read` 从一个文件中读取最后一条记录时)。它将会生成两个标量张量: 一个字符串和一个字符串关键值。

新创建一个名为 SomeReader 的读写器,需要以下步骤:

  1. 在 C++ 中, 定义一个 tensorflow::ReaderBase的子类,命名为 "SomeReader".
  2. 在 C++ 中,注册一个新的读写器Op和Kernel,命名为 "SomeReader"。
  3. 在 Python 中, 定义一个 tf.ReaderBase 的子类,命名为 "SomeReader"。

你可以把所有的 C++ 代码放在 tensorflow/core/user_ops/some_reader_op.cc文件中. 读取文件的代码将被嵌入到C++ 的 ReaderBase 类的迭代中。 这个 ReaderBase 类 是在 tensorflow/core/kernels/reader_base.h 中定义的。 你需要执行以下的方法:

  • OnWorkStartedLocked:打开下一个文件
  • ReadLocked:读取一个记录或报告 EOF/error
  • OnWorkFinishedLocked:关闭当前文件
  • ResetLocked:清空记录,例如:一个错误记录

以上这些方法的名字后面都带有 "Locked", 表示 ReaderBase 在调用任何一个方法之前确保获得互斥锁,这样就不用担心线程安全(虽然只保护了该类中的元素而不是全局的)。

对于 OnWorkStartedLocked, 需要打开的文件名是 current_work() 函数的返回值。此时的 ReadLocked 的数字签名如下:

Status ReadLocked(string* key, string* value, bool* produced, bool* at_end)

如果 ReadLocked 从文件中成功读取了一条记录,它将更新为:

  • *key: 记录的标志位,通过该标志位可以重新定位到该记录。 可以包含从 current_work() 返回值获得的文件名,并追加一个记录号或其他信息。
  • *value: 包含记录的内容。
  • *produced: 设置为 true。

当你在文件(EOF)末尾,设置 *at_end 为 true ,在任何情况下,都将返回 Status::OK()。 当出现错误的时候,只需要使用 tensorflow/core/lib/core/errors.h 中的一个辅助功能就可以简单地返回,不需要做任何参数修改。

接下来你讲创建一个实际的读写器Op。 如果你已经熟悉了添加新的Op 那会很有帮助。 主要步骤如下:

  • 注册Op。
  • 定义并注册 OpKernel。

要注册Op,你需要用到一个调用指令定义在 tensorflow/core/framework/op.h中的REGISTER_OP。

读写器 Op 没有输入,只有 Ref(string) 类型的单输出。它们调用 SetIsStateful(),并有一个 container 字符串和 shared_name 属性. 你可以在一个 Doc 中定义配置或包含文档的额外属性。 例如:详见 tensorflow/core/ops/io_ops.cc等:

 #include "tensorflow/core/framework/op.h"
REGISTER_OP("TextLineReader")
    .Output("reader_handle: Ref(string)")
    .Attr("skip_header_lines: int = 0")
    .Attr("container: string = ''")
    .Attr("shared_name: string = ''")
    .SetIsStateful()
    .Doc(R"doc(
A Reader that outputs the lines of a file delimited by '\n'.
)doc");

要定义一个 OpKernel, 读写器可以使用定义在tensorflow/core/framework/reader_op_kernel.h中的 ReaderOpKernel 的递减快捷方式,并运行一个叫 SetReaderFactory 的构造函数。 定义所需要的类之后,你需要通过 REGISTER_KERNEL_BUILDER(...) 注册这个类。

一个没有属性的例子:

 #include "tensorflow/core/framework/reader_op_kernel.h"
class TFRecordReaderOp : public ReaderOpKernel {
 public:
  explicit TFRecordReaderOp(OpKernelConstruction* context)
      : ReaderOpKernel(context) {
    Env* env = context->env();
    SetReaderFactory([this, env]() { return new TFRecordReader(name(), env); });
  }
};
REGISTER_KERNEL_BUILDER(Name("TFRecordReader").Device(DEVICE_CPU),
                        TFRecordReaderOp);

一个带有属性的例子:

 #include "tensorflow/core/framework/reader_op_kernel.h"
class TextLineReaderOp : public ReaderOpKernel {
 public:
  explicit TextLineReaderOp(OpKernelConstruction* context)
      : ReaderOpKernel(context) {
    int skip_header_lines = -1;
    OP_REQUIRES_OK(context,
                   context->GetAttr("skip_header_lines", &skip_header_lines));
    OP_REQUIRES(context, skip_header_lines >= 0,
                errors::InvalidArgument("skip_header_lines must be >= 0 not ",
                                        skip_header_lines));
    Env* env = context->env();
    SetReaderFactory([this, skip_header_lines, env]() {
      return new TextLineReader(name(), skip_header_lines, env);
    });
  }
};
REGISTER_KERNEL_BUILDER(Name("TextLineReader").Device(DEVICE_CPU),
                        TextLineReaderOp);

最后一步是添加 Python 包装器,你需要将 tensorflow.python.ops.io_ops 导入到 tensorflow/python/user_ops/user_ops.py,并添加一个 io_ops.ReaderBase的衍生函数。

from tensorflow.python.framework import ops
from tensorflow.python.ops import common_shapes
from tensorflow.python.ops import io_ops
class SomeReader(io_ops.ReaderBase):
    def __init__(self, name=None):
        rr = gen_user_ops.some_reader(name=name)
        super(SomeReader, self).__init__(rr)
ops.NoGradient("SomeReader")
ops.RegisterShape("SomeReader")(common_shapes.scalar_shape)

你可以在 tensorflow/python/ops/io_ops.py中查看一些范例。

编写一个记录格式Op

一般来说,这是一个普通的Op, 需要一个标量字符串记录作为输入, 因此遵循 添加Op的说明。 你可以选择一个标量字符串作为输入, 并包含在错误消息中报告不正确的格式化数据。

用于解码记录的运算实例:

请注意,使用多个Op 来解码某个特定的记录格式也是有效的。 例如,你有一张以字符串格式保存在 tf.train.Example 协议缓冲区的图像文件。 根据该图像的格式, 你可能从 tf.parse_single_example 的Op 读取响应输出并调用 tf.decode_jpegtf.decode_png, 或者 tf.decode_raw。通过读取 tf.decode_raw 的响应输出并使用tf.slicetf.reshape 来提取数据是通用的方法。

原文:Custom Data Readers 翻译:@derekshang 校对:Wiki


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